Trabzonspor'da 2018 yılında seçilip, 3 dönem başkanlık yapan Ahmet Ağaoğlu, 5 yılı bulan başkanlık görevinden istifa etti. Borç yükü altındaki kulüpte göreve geldikten sonra mali disiplin sağlayan ve geçen yıl camiaya şampiyonluk sevinci yaşatan Ağaoğlu, yeni sezonda katlanan borçlar ve yönetim kurulundaki kongre taleplerinin ardından görevinden istifa ederek yeni kurulacak yönetime yol açtı. 5 yıllık süreçte camiaya 4 kupa kazandıran Ağaoğlu, son şampiyon başkan olarak da tarihe geçti.
2022-23 sezonunda Şampiyonlar Ligi, Avrupa Ligi ve Konferans Ligi'ne veda eden, diğer yandan Süper Lig'de hedeflenen başarıdan uzaklaşan Trabzonspor'da, yönetim kurulu olağanüstü kongre kararı aldı. Kulüp başkanı Ahmet Ağaoğlu istifasını açıklayarak 2018'de başladığı ve 5 yılı bulan başkanlık macerasına da veda etti.
8 Nisan 2018 yılında yapılan 73'üncü Olağanüstü Genel Kurul'da Muharrem Usta'nın ardından kulübün 17'nci başkanı seçilen Ahmet Ağaoğlu, 5 yıldır bu görevde bulunuyordu. Sonrasında yapılan 2 genel kurulda da başkan seçilen Ağaoğlu, 3'üncü döneminde yönetim kurulunun talepleri doğrultusunda olağanüstü kongreye gidilmesinin yolunu istifa ederek açtı.
Ahmet Ağaoğlu, göreve geldiği dönemde Rıza Çalımbay'ın hocalık yaptığı takımın transfer politikasını sürdürülebilir ekonomi ve finansal fair-play kurallarını gözeterek belirlemişti. Takım içerisindeki birlikteliği korumaya çalışan Ağaoğlu başkanlığındaki Karadeniz ekibi, sezonu 5'inci sırada tamamlamıştı. 2018-19 sezonunda yeni bir sayfa açan ve Rıza Çalımbay ile yolları ayıran Ağaoğlu, Ünal Karaman'ı teknik direktörlük görevine getirmişti. Sezonu 4'üncü sırada tamamlayan bordo mavili takımda, Karaman ile yönetim arasında yaşanan gerilim nedeniyle yollar ayrılarak, 2019-20 sezonun ilk yarısının bitiminde takımı Hüseyin Çimşir'e emanet edilmişti.
Ligin 20'nci haftasında liderlik koltuğuna oturan Karadeniz ekibi, 28'inci haftada zirveyi Başakşehir'e kaptırarak şampiyonluğun kıyısından dönmüştü. Ligin bitimi beklenmeden Çimşir'le yolları ayıran Ağaoğlu, son lig maçı ve Ziraat Türkiye Kupası finalinde takımı yardımcı antrenör Eddie Newton'a teslim etmişti. Ziraat Türkiye Kupası'nı Eddie Newton yönetiminde kazanan bordo mavililerde 2020-21 sezonunun ilk 7 haftasında alınan kötü sonuçların ardından İngiliz hocayla da yollar ayrılmış, takım geçici olarak İhsan Derelioğlu ile çalışmıştı.
Teknik direktör Abdullah Avcı'yı 2020 yılı Kasım ayında göreve getiren Ahmet Ağaoğlu, görev sürecinde çalıştığı son teknik adamla istediği başarıyı yakaladı. Karadeniz ekibi, Avcı'nın ilk döneminde Süper Kupa finalinde Medipol Başakşehir'i yenerek Süper Kupa'yı da müzesine götürdü. Sezon sonunda ligi 4'üncü sırada tamamlayan bordo mavililer, 2021-22 sezonunda ligin bitimine 3 hafta kala şampiyonluğu ilan ederek şampiyonluk kupasını müzeye taşıdı. 2022 yılı Ziraat Türkiye Kupası şampiyonu Sivasspor'u da deviren bordo mavililer, Ağaoğlu başkanlığındaki kulübe üçüncü kupayı kazandırdı.
Trabzonspor'a başkan olduğu dönemde mali disiplin sağlama sözü verip şampiyonluk için kendisine 4 yıl süre verilmesini isteyen Ağaoğlu, Avcı yönetimindeki Trabzonspor'la sözünü de gerçekleştirmiş oldu. 5 yıllık görev süresi boyunca camiaya 1 Süper Lig şampiyonluğu, 1 Ziraat Türkiye Kupası ve 2 Süper Kupa kazandıran Ahmet Ağaoğlu, 38 yıllık şampiyonluk hasretine son veren başkan olarak Trabzonspor tarihine yazıldı.