Trabzonspor’da oynadığı 2.5 sezonun ilk sezonun da gösterdiği başarılı performansla adından söz ettirip sözleşme yenileme sıkıntısından dolayı sorunlar yaşayıp takımdan ayrılan Mehmet ekici Fenerbahçe’ye transfer olmuştu.
3 sezon formasını giydiği Fenerbahçe’de ise bir türlü sakatlıktan kurtulamamış ve etkili bir performans gösterememişti.
2020 yazında ayrıldığı Fenerbahçe’den sonra herhangi bir takımla anlaşamayan oyuncu 2 senedir futbol oynamıyor gelen son haberlere göre ise futbolcunun emeklilik kararı aldığı iddia edildi.